ผ่านมาเกือบ 5 ปี หลังจากเหตุการณ์ที่เกิดขึ้น โจนาส เทย์เลอร์ ตอนนี้กำลังใช้ชีวิตอยู่กับ เมย์ยิ่ง เด็กสาวอายุ 14 ปี ที่เขารับเลี้ยงดูหลังจากที่แม่ของเธอเสียชีวิตลง ซึ่งในตอนนี้เขานั้นทำอาชีพเป็นผู้ช่วยในการสำรวจ และทำแผนที่ของร่องลึกบาดาลมาเรียนา เพื่อใช้ในการจัดการกับภัยร้ายต่างๆ ที่มักจะเกิดขึ้นบ่อยครั้งอย่างเลี่ยงไม่ได้
ซึ่งในระหว่างปฏิบัติงานอยู่ โจนาส ก็ต้องพบว่า เมย์ยิ่ง นั้นได้แอบซ่อนเข้ามายังเรือดำน้ำที่เขาใช้ทำงานอยู่ด้วย พร้อมกับที่ทั้งพวกเขาได้พบกับสถานีขุดเหมืองแร่ที่ถูกซ่อนเอาไว้ใต้สุดของมหาสมุทรอีกด้วย และเมื่อยิ่งสำรวจเข้าไปมากเท่าไหร่ก็มีปริศนาเพิ่มขึ้นเท่านั้น แต่แล้วเมื่อเรือดำน้ำของพวกเขาถูกวางยาและเกิดพังขึ้นมา นั่นทำให้พวกเขาเริ่มสงสัยหนอนบ่อนไส้ที่อยู่ในทีมพวกเขา และพวกเขาจะเอาชีวิตรอดจนกว่าความช่วยเหลือจะมาได้หรือไม่